我院儿科设有新生儿科、小儿呼吸（哮喘）专科、小儿内分泌专科、小儿变态反应（过敏）专科等特色专科，并拥有肺功能仪、呼出气一氧化氮检测仪、过敏原检测、小儿生长发育检测等。长期与上海复旦大学儿科医院、南京医科大学附属南京儿童医院、南京市妇幼保健院、江苏大学附属医院、镇江市妇幼保健院开展合作，已与之形成良好的人员培训、技术指导、科学研究、疑难病会诊和双向转诊等方面的合作关系。